1. 加强植物检疫。防止线虫随种子（种薯）、种苗和病株根系、土壤携带等进行传播。
2. 选种较抗病或耐病的品种。茄科作物和大豆分别存在抗根结线虫和大豆孢囊线虫的品种，但葫芦科（瓜类）蔬菜目前尚无抗病品种或砧木。
3. 农业或园艺防治。
主要包括：
（1）轮作或休闲；
（2）利用植物诱捕；
（3）加强栽培管理（如调整播种期、增施有机肥、定植后适当勤灌浸淹、小麦播后镇压等）。
4. 注意田间卫生。
主要包括：
（1）彻底清除病根、病块茎等病残体；
（2）清除田间杂草；
（3）避免农具和鞋靴携带传播。
5. 物理防治。
主要包括：
（1）种子风选、水选和温汤浸种；
（2）太阳能土壤消毒；
（3）蒸汽等土壤热力消毒。
6. 生物熏蒸。利用来自十字花科或菊科植物有机物释放的有毒气体杀灭线虫，混加畜禽粪便（氮或氨）和海产品下脚料（几丁质和氨）效果更佳。
7. 生物防治。目前可选择的有淡紫拟青霉、厚垣孢普可尼亚菌和多种芽孢杆菌等微生物源生防菌剂，以及印楝素等植物源生物制剂。
8. 化学防治。化学杀线虫剂分熏蒸性的和非熏蒸性的。熏蒸性的主要有异硫氰酸甲酯、异硫氰酸烯丙酯、棉隆、威百亩，氰氨化钙（石灰氮）也有一定熏蒸作用。非熏蒸性的主要有噻唑膦、阿维菌素、氟吡菌酰胺、氟烯线砜等。一些新型杀线虫剂有望近期推向市场；一些地区采用臭氧进行土壤消毒来防治线虫。
9. 注重土壤健康水平提升，综合和规范使用绿色和可持续的治理技术，加强专业化、市场化线虫防控服务体系和队伍建设。
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